高通量测序技术研究长链非编码RNA AOC4P对上皮性卵巢癌的影响

摘要:

目的 探讨长链非编码 RNA AOC4P 对上皮性卵巢癌的影响。方法 阴性对照小干扰 RNA（siRNA NC）、AOC4P 小干扰 RNA（AOC4P-siRNA）分别转染卵巢癌细胞系，设为对照组和 AOC4P 沉默组。运用高 通量测序技术检测两组的差异表达基因，通过生物信息学技术对差异表达基因进行分析，使用GEPIA2 数据 库、蛋白印记实验对关键基因进行验证。通过 FunRich 软件及 miRcode 网站预测 AOC4P-miRNA-关键基因 的调控网络。结果 两组卵巢癌细胞系差异表达基因 73 个。生物信息学分析显示主要富集在细胞核中， 通过蛋白质结合的方式发挥作用，主要影响增殖过程，并且主要涉及凋亡和肿瘤坏死因子信号通路。增殖 相关的生物学过程所富集的差异表达基因共 10 个，其中下调 2 个，上调 8 个，CDKN1B 获得了最高的差异 倍数变化（–5.46 倍），GEPIA2 数据库数据及蛋白印记实验进一步证实了CDKN1B的表达变化。基于AOC4P 与CDKN1B的miRNA调控网络的预测结果发现，miR-24-3p可能是AOC4P和CDKN1B 共交集的miRNA。 结论 AOC4P 可能通过 miR-24-3p 调节靶基因 CDKN1B 的表达，从而影响上皮性卵巢癌的细胞增殖。

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